全书共分四卷

第一卷是论对上帝的认识，认上帝为宇宙有宇宙间万有的创造者，保守者和管理者。
第二卷论述对上帝在基督里为救赎者的认识。
第三卷论述使我们与基督联合的圣灵，并论我们借以接受基督的信仰和他的双重恩赐。
第四卷论述教会以及圣灵所用的以选召和保存教会的工具、即圣道与圣礼（即圣洗与圣餐）。
加尔文的神学思想主要强调圣经是基督教信仰的唯一根据和权威。主张因信称义和预定论，这种预定论是加尔文神体系的基石。